課程簡(jiǎn)介

• 課程類型：技術(shù)培訓(xùn)
• 報(bào)名時(shí)間：2019年12月20日 00時(shí)00分- 2020年01月09日 17時(shí)00分
• 報(bào)名方式：在線報(bào)名
• 限制人數(shù)：50(單位：人)
• 課程形式：培訓(xùn)會(huì)

課程內(nèi)容

 課程介紹

課程介紹 主辦方介紹

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2020生物數(shù)據(jù)分析技能2.0實(shí)訓(xùn)會(huì)(總第22期,1月合肥班)宣傳圖

生物醫(yī)學(xué)已進(jìn)入大數(shù)據(jù)時(shí)代，借助生物醫(yī)學(xué)多組學(xué)、多層次的海量數(shù)據(jù)，可以從前所未有的廣度和深度來研究生物體運(yùn)行機(jī)制。由于生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)多呈分散復(fù)雜特征，以海量數(shù)據(jù)挖掘與分析為主體內(nèi)容的生物信息學(xué)技能就成為科研必要手段，如疾病的病因?qū)W、臨床診斷標(biāo)志物、治療或作用靶點(diǎn)識(shí)別，關(guān)鍵大分子的發(fā)現(xiàn)與功能預(yù)測(cè)，以及遺傳調(diào)控機(jī)制等方面。本課程曾先后用名《基因序列分析技術(shù)》和《功能基因組信息分析技術(shù)》，后將上述兩門課程整合更名為《生物數(shù)據(jù)分析技能》，此前共計(jì)舉辦了21期。自本期會(huì)議起，會(huì)議升級(jí)為《生物數(shù)據(jù)分析技能2.0》，對(duì)課程內(nèi)容與培訓(xùn)日程進(jìn)行了大幅度調(diào)整，遞進(jìn)式專注講解高通量數(shù)據(jù)解析：表達(dá)數(shù)據(jù)挖掘→共表達(dá)（聚類、富集、相互作用）分析→構(gòu)建調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，以順應(yīng)學(xué)科發(fā)展和滿足學(xué)員實(shí)際需要。授課繼續(xù)沿用主講教師獨(dú)創(chuàng)的TPS（Teaching-Practicing-Showing）教學(xué)模式，著力于以真實(shí)問題為引線，將理論授課與上機(jī)實(shí)踐有機(jī)地融為一體，逐步介紹涉及的各項(xiàng)技能，指導(dǎo)學(xué)員將其融會(huì)貫通并應(yīng)用到課題研究中。TPS教學(xué)模式多年來在本科、研究生教學(xué)及20余期各類培訓(xùn)會(huì)議中取得了極佳的教學(xué)效果，受到廣大學(xué)員的一致好評(píng)和推崇。

時(shí)間地點(diǎn)：

2020年1月10日-12日(周五-周日)(周五報(bào)到，周六-周日授課兩天一夜)


合肥伯爵世家酒店(合肥市瑤海區(qū)北二環(huán)雙七路156號(hào))

主辦單位：

北京華斯泰生物醫(yī)學(xué)科技有限公司

培訓(xùn)日程

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培訓(xùn)日程：(所有課程均含上機(jī)實(shí)踐)

日期	時(shí)間	授課題目	授課內(nèi)容
1月10日	16:00-21:00	培訓(xùn)簽到-領(lǐng)取資料
1月11日	08:00-08:30	軟件安裝，調(diào)試運(yùn)行
	08:30-10:30	表達(dá)譜差異數(shù)據(jù)挖掘	差異表達(dá)基因集（DEGs）分析策略。 GEO數(shù)據(jù)庫(kù)檢索及數(shù)據(jù)集在線分析。 利用GEO2R在線工具篩選獲得差異表達(dá)基因集，并獲得TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)交集結(jié)果。
	10:30-12:00	表達(dá)譜數(shù)據(jù)聚類分析	利用ArrayTools軟件（設(shè)置各項(xiàng)參數(shù)）處理GEO數(shù)據(jù)庫(kù)下載的表達(dá)譜數(shù)據(jù)。 表達(dá)譜數(shù)據(jù)聚類分析。 聚類圖形優(yōu)化工具。
	14:00-17:30	基因集功能富集分析	利用DAVID、Metascape在線工具進(jìn)行基因集功能富集分析（GO MF、GO BP、GO CC；KEGG Pathway）。 繪制或下載基因集功能富集圖。 基因集韋恩圖分析。 基因集ID多元轉(zhuǎn)換。
	19:00-22:00	基因集相互作用分析	利用String在線工具（設(shè)置各項(xiàng)參數(shù)）獲得基因集相互作用結(jié)果。 mRNA-miRNA、miRNA-lncRNA、miRNA-circRNA、mRNA-circRNA相互作用分析。
1月12日	08:30-12:00	交互作用數(shù)據(jù)可視化	利用Cytoscape軟件進(jìn)行基因注釋、分子間相互作用、基因集差異表達(dá)的可視化分析。 批量修改交互網(wǎng)絡(luò)的節(jié)點(diǎn)、邊、背景屬性。 利用Cytoscape App進(jìn)行基因集交互網(wǎng)絡(luò)的GO富集分析、文本挖掘、關(guān)鍵/瓶頸基因及核心基因篩選。 高分辨率可視化結(jié)果的保存與輸出。
	13:30-16:00	共表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建	構(gòu)建基因集差異共表達(dá)Pathway/circRNA-mRNA-miRNA-lncRNA/circRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。 靶點(diǎn)基因分析策略。

 會(huì)議嘉賓

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即將更新，敬請(qǐng)期待

會(huì)議費(fèi)用

會(huì)議費(fèi)用

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會(huì)議費(fèi)用：

2019年12月20日前報(bào)名并繳費(fèi)3200元/人，12月20日后3400元/人（5人及以上團(tuán)體報(bào)名并實(shí)際報(bào)到另優(yōu)惠300元/人），授課期間發(fā)放紙質(zhì)邀請(qǐng)函（蓋章）和發(fā)票。
本次會(huì)議費(fèi)委托合肥華斯泰生物醫(yī)學(xué)科技有限公司收取并統(tǒng)一提供會(huì)務(wù)發(fā)票。

具體事宜：

1. 培訓(xùn)期間提供午餐、11日晚餐。住宿統(tǒng)一安排在合肥伯爵世家酒店（合肥站店），主辦單位可為學(xué)員代訂房間，標(biāo)準(zhǔn)間/單人間200元/間（含早餐），費(fèi)用自理；學(xué)員也可自行上網(wǎng)預(yù)訂。住宿費(fèi)發(fā)票在退房時(shí)由酒店開具。對(duì)于需要合住的學(xué)員，會(huì)務(wù)組將按報(bào)到先后順序安排，最后出現(xiàn)單人無法安排的情況，需要自補(bǔ)房間差價(jià)。


2. 上機(jī)實(shí)踐需自帶筆記本電腦（非上網(wǎng)本），會(huì)場(chǎng)將布置充足的電源插座。請(qǐng)確保電腦配置無線網(wǎng)卡（無線wifi覆蓋會(huì)場(chǎng)）。為提高上網(wǎng)效率，推薦自行攜帶4G無線上網(wǎng)卡或具有熱點(diǎn)共享功能的手機(jī)。操作系統(tǒng)為Win7/8/10 64位專業(yè)版（非任何商業(yè)版及Mac系統(tǒng)），辦公軟件為Office 2010以上專業(yè)版（非任何商業(yè)版及WPS Office），否則無法保證全部軟件順利安裝和使用。


3. 授課幻燈、軟件（附安裝指南）及上機(jī)實(shí)踐文檔已上傳至百度網(wǎng)盤，在報(bào)到通知中會(huì)告知鏈接及密碼。軟件請(qǐng)事先下載并安裝，如安裝有問題，請(qǐng)咨詢客服或開課當(dāng)天到會(huì)場(chǎng)咨詢。


4. 嚴(yán)格按照培訓(xùn)日程授課（共計(jì)22標(biāo)準(zhǔn)學(xué)時(shí)），第二天16:00結(jié)課，方便外地學(xué)員返程。

注意事項(xiàng)