上海醫(yī)藥工業(yè)研究院科研機構(gòu)設置及其科研方向涵蓋了整個藥學領(lǐng)域,可進行化學合成藥物、微生物與生化藥物、中藥和中藥現(xiàn)代化制劑、藥物新型制劑的研究開發(fā)以及有關(guān)重大品種生產(chǎn)工藝的技術(shù)創(chuàng)新。近年來,國家食品藥品監(jiān)督管理局等部委在我院相繼設立了國家藥品包裝材料檢測中心、國家醫(yī)藥工業(yè)信息中心、藥物制劑國家工程研究中心、國家(上海)新藥安全評價研究中心4個國家級中心,已具備與國際接軌的科研設施、科研水平。是中國醫(yī)藥工業(yè)科研人才的重要聚集地和輸出源,現(xiàn)有中國工程院院士2人,享受國務院特殊津貼專家65人,新藥評審專家12人,系藥學一級學科博士學位授予權(quán)單位,擁有藥學領(lǐng)域多學科的博士培養(yǎng)資格,自2000年2月起,與上海交通大學共建“上海交通大學藥學院”。